Vrtložni mjerači obično se ne preporučuju za doziranje ili druge primjene isprekidanog protoka. To je zato što postavka protoka driblinga stanice za doziranje može pasti ispod minimalnog ograničenja Reynoldsovog broja mjerača. Što je manja ukupna serija, to će rezultirajuća pogreška vjerojatno biti značajnija.

Plinovi niskog tlaka (niske gustoće) ne proizvode dovoljno jak puls tlaka, osobito ako su brzine tekućine niske. Stoga je vjerojatno da će u takvim uslugama raspon raspona mjerača biti loš, a niski protoci neće biti mjerljivi. S druge strane, ako je smanjena mogućnost raspona prihvatljiva i mjerač je ispravno dimenzioniran za normalan protok, vrtložni mjerač protoka još uvijek se može uzeti u obzir.

Ako procesna tekućina ima tendenciju prekrivanja ili nakupljanja na tjemenu, kao u slučaju mulja i gnojnice, to će na kraju promijeniti K faktor mjerača. Mjerači protoka s vrtložnim odvajanjem ne preporučuju se za takve primjene. Međutim, ako prljava tekućina ima samo umjerene količine neobloženih krutina, primjena će vjerojatno biti prihvatljiva. To je dokazano 2-godišnjim testom na vapnenačkoj kaši. Na kraju testa, utvrđeno je da se faktor K promijenio samo 0.3% u odnosu na izvornu tvorničku kalibraciju, iako su tijelo i protočna cijev bili jako oštećeni i izdubljeni.

Prilikom mjerenja višefaznog protoka (krute čestice u plinu ili tekućini; mjehurići plina u tekućini; kapljice tekućine u plinu), točnost vortex mjerača će pasti zbog nemogućnosti mjerača da razlikuje faze. Vlažna para niske kvalitete jedna je od takvih primjena: tekuća faza treba biti homogeno raspršena unutar pare, a treba izbjegavati vertikalne linije protoka kako bi se spriječilo nakupljanje. Kada je cijev vodoravna, tekuća faza će vjerojatno putovati po dnu cijevi, pa stoga unutarnje područje cijevi treba držati otvorenim na dnu. To se može postići vodoravnom ugradnjom tijela blefa. Netočnost mjerenja u takvim primjenama je oko 5% stvarnog protoka, ali uz dobru ponovljivost.

Trajni gubitak tlaka kroz vortex mjerač je otprilike polovica gubitka tlaka na ploči s otvorom, otprilike dvije visine brzine. (Napon brzine definiran je kao V2/g, gdje je V brzina protoka, a g gravitacijska konstanta u dosljednim jedinicama.) Ako su cijev i mjerač odgovarajuće veličine i iste veličine, pad tlaka će vjerojatno biti samo nekoliko psi. Međutim, smanjivanje (ugradnja mjerača veličine manjeg od linije) kako bi se povećao Reynolds može povećati gubitak visine na više od 10 psi. Također treba paziti da tlak vena contracta ne padne ispod tlaka pare procesne tekućine jer bi to uzrokovalo kavitaciju. Naravno, ako je protutlak na mjeraču ispod tlaka pare, procesna tekućina će bljeskati, a očitanje mjerača neće imati smisla.